创新创业学院接受学校创新创业工作领导小组领导，在创新创业教育指导委员会指导、监督下，设立创新创业研究所、创新创业教研室、双创综合服务中心、综合办公室四个职能部门。其中，创新创业研究所主要开展创新创业科研、教研以及产学研双创研究工作；创新创业教研室负责全校创新创业课程开发、教学、培训，以及跨学科教学团队建设；双创综合服务中心对接校内外创新创业资源，服务各类大学生创新创业实践；综合办公室负责学院日常行政事务。